1. La Direcció General està formada pel director general i fins a quatre directors que exerceixen la direcció d’una àrea especialitzada d’acord amb l’estructura orgànica de l’INAF.
2. El director general de l’INAF és nomenat pel Govern a proposta del Consell d’Administració de l’INAF.
3. La durada del càrrec de director general és de sis anys renovable indefinidament.
4. Els directors són nomenats pel Consell d’Administració de l’INAF, a proposta del director general, preferentment d’entre el personal de l’INAF.
5. En cas d’absència del director general, per motiu de malaltia, vacances, desplaçaments laborals, causa de força major o altres causes i quan el director general ho delegui, la competència de substituir el director general serà atribuïda a un dels directors, fins a un període màxim d’un any.
6. En cas de cessament del director general o en cas que aquest sigui separat del seu càrrec, el Consell d’Administració ha de nomenar un director general interí.
7. La remuneració i la resta de condicions del contracte de treball del director general són fixades pel Govern.
8. La remuneració i la resta de condicions del contracte de treball dels directors són fixades pel director general, d’acord amb les polítiques de gestió de persones i remuneració aprovades pel Consell d’Administració.